Me interesa su proyecto, soy analista y desarrollador.
Mi percepción y observaciones:
1. Está claro que se desea replicar información desde una BD local a otra remota ("PhpMyAdmin"). Cabe suponer que la plataforma local es de tipo Linux, puesto que se solicita un daemon para correr ahí. No se informa el tipo o proveedor de la BD local, posiblemente es relacional con SQL.
2. La vía más directa para insertar en la BD remota es configurando el servidor que la aloja para que el puerto de servicio (habitualmente 3306) quede expuesto hacia la red. Si no es posible acceder directamente a la BD en el host remoto hay otras opciones técnicas que se pueden explorar.
3. Si la BD local es como la remota, podría ser viable configurar la función de réplica automática que ya viene de origen, y no habría que desarrollar un daemon.
4. Si el daemon es indispensable, no hay problema en poner en la interface del usuario la gestión de la configuración y el arranque y paro.
Respecto a mi experiencia previa programando daemon, desarrollé uno en C para ejecutar las transacciones de un ERP para una industria textil, aquí en México. Corre en el mismo servidor de web y BD. Se lo puedo mostrar y explicar con todo gusto.
Usualmente cotizo con un presupuesto proporcional al esfuerzo requerido. Para su proyecto hay que validar los detalles y por lo tanto el presupuesto es solamente indicativo.
Gracias por su atención. Si le interesa mi ayuda contácteme vía Chat.